Исполнительный комитет РАТС ШОС поступательно наращивает сотрудничество с внешними партнерами - профильными структурами международных и региональных организаций.
Данные меры принимаются в рамках реализации Глобальной Контртеррористической Стратегии ООН, единогласно одобренной Генеральной Ассамблеей ООН в 2006 году в форме резолюции и прилагаемого Плана действий.
Деятельность РАТС ШОС в этом направлении имеет важное значение для развития общих усилий мирового сообщества в координации совместных действий по сохранению надлежащего уровня безопасности на региональном и глобальном уровнях.
В сотрудничестве с внешними партнерами, РАТС традиционно руководствуется системными и программными подходами, которые закреплены в соответствующих документах. Это, в частности, трехлетние Программы сотрудничества государств-членов ШОС в сфере борьбы с терроризмом, сепаратизмом и экстремизмом, а также различные совместные меры и планы РАТС ШОС.
17 сентября 2017 года Решением Совета РАТС ШОС утверждены Меры по повышению эффективности взаимодействия РАТС ШОС с международными организациями, выполняющими задачи по борьбе с терроризмом, сепаратизмом и экстремизмом.
Во исполнения указанного Решения, РАТС ШОС юридически оформил свои партнерские взаимоотношения с основными глобальными и региональными организациями путем подписания следующих международно-правовых документов:
- Порядок осуществления рабочих контактов между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и Антитеррористическим центром государств-участников Содружества Независимых Государств (г. Москва, 23.01.2006 г.);
- Протокол о намерениях между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и Советом командующих Пограничными войсками государств-участников Содружества Независимых Государств (г. Москва, 20.10.2008 г.);
- Протокол о сотрудничестве между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и Центрально-азиатским региональным информационным координационным центром по борьбе с незаконным оборотом наркотических средств, психотропных веществ и их прекурсоров (г. Алматы, 27.09.2010 г.);
- Протокол о сотрудничестве между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и Секретариатом Организации Договора о коллективной безопасности (г. Астана, 14.06.2011 г.);
- Протокол о сотрудничестве между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и Управлением Организации Объединенных Наций по наркотикам и преступности (г. Алматы, 22.07.2011 г.);
- Меморандум о взаимопонимании и сотрудничестве между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и Исполнительным директоратом Контртеррористического комитета Совета Безопасности Организации Объединенных Наций (Братислава, 25 марта 2019г.);
- Протокол сотрудничества между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и Евразийской группой по противодействию легализации преступных доходов и финансированию терроризма (г.Москва, 20 июня 2014 г.);
- Меморандум о взаимопонимании между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и ИНТЕРПОЛом (Монако, 6 ноября 2014);
- Протокол о сотрудничестве между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и Секретариатом Совещания по взаимодействию и мерам доверия в Азии (20 сентября 2017г.);
- Меморандум о взаимопонимании по вопросам сотрудничества и взаимодействия между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества, Антитеррористическим Центром государств - участников Содружества Независимых Государств и Секретариатом Организации Договора о коллективной безопасности (Москва, 28 мая 2018 года);
- Меморандум о взаимопонимании и сотрудничестве между Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества и Африканского Центром по изучению и исследованию терроризма (Алжир, 11 декабря 2018г.);
- Меморандум о взаимопонимании между Организацией Объединенных Наций в лице Контртеррористического управления ООН и Региональной антитеррористической структурой Шанхайской организации сотрудничества (Нью-Йорк, 19 февраля 2020г.);
Платформой для теоретико-практического обмена мнениями и обсуждению насущных вопросов в области борьбы с терроризмом и экстремизмом является Международная научно-практическая конференция РАТС ШОС.
Данная конференция является ежегодным мероприятием, проводимым РАТС ШОС с 2013 года. Конференция начиналась в форме «круглого стола» с участием исследователей из государств-членов и государств-наблюдателей ШОС. С тех пор число участников ежегодной Конференции выросло примерно до 50 докладчиков, среди которых, помимо государств-членов и государств-наблюдателей ШОС, партнеры по диалогу ШОС, международные и региональные организаций, а также научные, исследовательские, информационные и аналитические институты.